中國電子商務在十多年的發展中已逐步趨于成熟，其市場現狀也在發展中不斷演變進化。但隨著電子商務發展，一些問題也逐漸顯露出來了，主要表現如下幾個方面：
物流配送能力不足。從國內整體狀況來看，缺乏系統化、專業化的全國性貨物配送企業，現有的物流企業呈現分散的多元化格局，導致專業化流通的集約經營優勢難以發揮，規模效益難以實現。
社會信用體系建設支撐不夠。信用評估嚴重匱乏、市場行為缺乏社會監督，導致假冒偽劣商品屢禁不止，電子商務市場魚龍混雜、良莠不分，嚴重制約著電子商務的發展。
安全體系建設滯后。電子商務的運作涉及資金安全、信息安全、商業秘密等。目前網上安全技術及認證機制均不夠完善，各方當事人對在網上從事電子商務交易總心存疑慮，影響消費者參與電子商務的積極性。
針對目前電子商務存在一些問題，各企業都在不斷改進完善促進電子商務的發展，電子商務未來發展將呈現如下趨勢：
走多元化發展道路。 走多元化道路已在業內達成了共識。國內領軍企業都將多元化發展作為未來的重要戰略之一，最典型的多元化發展的企業是阿里巴巴，其電子商務目前覆蓋了 C2C、B2C、B2B的全部電子商務領域，并開始向物流配送行業滲透，對其他企業的發展有巨大的示范效應。
強強聯合的形式不斷呈現。電子商務網站將會出現兼并熱潮。首先是同類兼并，目前國內很多網站屬于定位相同或相近，業務內容趨同。由于資 源有限，并且在互聯網“贏家通吃”原則下，最終勝出的只是名列前茅的網站。其次是互補性兼并，那些處于領先地位的電子商務企業在資源、品牌、客戶規模等諸 多方面具有很強的優勢，不同類型的網站以戰略聯盟的形式進行相互協作將成為必然趨勢。
行業化進一步拓展。隨著電子商務技術創新與集成度的提高，企業電子商務將向縱深挺進，行業電子商務將成為下一代電子商務發展主流。中國 電子商務將從以往的“大而全”模式轉向專業細分的行業商務門戶。第一代的電子商務專注于內容，第二代專注于綜合性電子商務，而下一代的行業電子商務將增值 內容和商務平臺緊密集成，充分發揮 Internet在信息服務方面的優勢，使電子商務真正進入實用階段。
個性化將得到進一步體現。由于目前電子商務已經很成熟，在企業開展電子商務的過程中將更多的體現企業個性化特性，將不斷創造出滿足自身發展的電子商務模式，將打破傳統虛擬網店和實體店的嚴格界限，實現企業經營發展的統一。
